MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 98

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017816	AG	3	6	75	80	50 %	0 %	50 %	0 %	386858646
2	NC_017816	TAA	2	6	85	90	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858646
3	NC_017816	TTG	2	6	93	98	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858646
4	NC_017816	AGATA	2	10	175	184	60 %	20 %	20 %	0 %	386858646
5	NC_017816	CTA	2	6	252	257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858646
6	NC_017816	AGT	2	6	319	324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858646
7	NC_017816	GAT	2	6	356	361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858646
8	NC_017816	TGA	2	6	370	375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858646
9	NC_017816	ATT	2	6	421	426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858646
10	NC_017816	TGC	2	6	433	438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858646
11	NC_017816	A	6	6	455	460	100 %	0 %	0 %	0 %	386858646
12	NC_017816	CAG	3	9	462	470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858646
13	NC_017816	GCA	2	6	473	478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858646
14	NC_017816	ATG	2	6	531	536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858646
15	NC_017816	AAT	2	6	560	565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858646
16	NC_017816	ATT	2	6	619	624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858646
17	NC_017816	AGC	2	6	700	705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858646
18	NC_017816	AAG	2	6	751	756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858646
19	NC_017816	TGA	2	6	763	768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858646
20	NC_017816	TAA	2	6	792	797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858646
21	NC_017816	TAC	2	6	805	810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858646
22	NC_017816	GTA	2	6	815	820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858646
23	NC_017816	TGG	2	6	839	844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017816	AGT	2	6	853	858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017816	TA	3	6	879	884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017816	AAT	2	6	889	894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017816	AT	3	6	961	966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017816	AT	3	6	987	992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017816	TAT	2	6	1000	1005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017816	TTAA	2	8	1039	1046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017816	A	6	6	1081	1086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017816	A	6	6	1126	1131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017816	TAA	2	6	1154	1159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017816	ATA	2	6	1244	1249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017816	ATTTTT	2	12	1263	1274	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017816	ATT	2	6	1307	1312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017816	T	6	6	1325	1330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017816	A	8	8	1352	1359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017816	A	6	6	1361	1366	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017816	AGG	2	6	1382	1387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017816	GAA	2	6	1389	1394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017816	A	6	6	1408	1413	100 %	0 %	0 %	0 %	386858647
43	NC_017816	GA	3	6	1421	1426	50 %	0 %	50 %	0 %	386858647
44	NC_017816	GAA	2	6	1430	1435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858647
45	NC_017816	GAGAG	2	10	1436	1445	40 %	0 %	60 %	0 %	386858647
46	NC_017816	AAGG	2	8	1446	1453	50 %	0 %	50 %	0 %	386858647
47	NC_017816	TGG	3	9	1478	1486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858647
48	NC_017816	TGA	2	6	1487	1492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858647
49	NC_017816	GA	3	6	1523	1528	50 %	0 %	50 %	0 %	386858647
50	NC_017816	AG	3	6	1533	1538	50 %	0 %	50 %	0 %	386858647
51	NC_017816	TGG	2	6	1565	1570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858647
52	NC_017816	CTT	2	6	1601	1606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858647
53	NC_017816	TGG	2	6	1616	1621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858647
54	NC_017816	AAG	2	6	1651	1656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858647
55	NC_017816	GTT	2	6	1726	1731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858647
56	NC_017816	AG	3	6	1773	1778	50 %	0 %	50 %	0 %	386858647
57	NC_017816	TGG	2	6	1821	1826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858647
58	NC_017816	TAG	2	6	1946	1951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858647
59	NC_017816	AGG	2	6	1965	1970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858647
60	NC_017816	GAT	2	6	1987	1992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858647
61	NC_017816	TGG	2	6	2022	2027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858647
62	NC_017816	CTG	2	6	2036	2041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858647
63	NC_017816	CAG	2	6	2102	2107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858647
64	NC_017816	TGT	2	6	2205	2210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858647
65	NC_017816	A	6	6	2224	2229	100 %	0 %	0 %	0 %	386858647
66	NC_017816	TAA	3	9	2295	2303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858647
67	NC_017816	GCA	2	6	2338	2343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858647
68	NC_017816	AAG	2	6	2388	2393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858647
69	NC_017816	ATT	2	6	2416	2421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858647
70	NC_017816	AAG	2	6	2423	2428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858647
71	NC_017816	AAG	2	6	2491	2496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858647
72	NC_017816	TAT	2	6	2502	2507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017816	TAA	2	6	2524	2529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017816	AT	3	6	2532	2537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017816	GAT	2	6	2543	2548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017816	T	7	7	2599	2605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017816	TTGT	2	8	2622	2629	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017816	TAA	2	6	2635	2640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017816	TG	4	8	2651	2658	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017816	TAT	2	6	2659	2664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017816	ATTT	2	8	2692	2699	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017816	TG	4	8	2702	2709	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017816	TAA	2	6	2772	2777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017816	A	8	8	2787	2794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017816	GAGAA	2	10	2801	2810	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017816	CTG	2	6	2910	2915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017816	AAG	2	6	2916	2921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017816	TTA	2	6	2936	2941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017816	ACC	2	6	2996	3001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_017816	CTC	2	6	3022	3027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_017816	CTG	2	6	3031	3036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017816	CTA	2	6	3046	3051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017816	AAAT	2	8	3092	3099	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017816	AT	3	6	3152	3157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017816	TTAT	2	8	3158	3165	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017816	AAG	2	6	3167	3172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017816	ATTA	2	8	3211	3218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017816	TTAC	2	8	3258	3265	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.